Xanthoria parietina jest pierwszym grzybem porostowym, który zostanie zsekwencjonowany. Porost jest związkiem między grzybem (Zwykle ascomycete) a mikroalgą lub cyjanobakterią lub obydwoma. Porosty są powszechnie uważane za klasyczny przykład symbiozy mutualistycznej. Porosty rosną w siedliskach mniej glebowych, takich jak na skałach lub korze drzew, lub na słabo rozwiniętych glebach. Chociaż te siedliska występują we wszystkich biomach lądowych, są one szczególnie obfite na wysokich szerokościach geograficznych w Subarktyce, Arktyce i Antarktyce, gdzie porosty mają ogromne znaczenie ekologiczne i gdzie globalne ocieplenie i zmiana klimatu stanowią szczególne zagrożenie.
istnieje około 13 500 gatunków grzybów tworzących porosty, z których każdy tworzy odrębny związek porostów (np. Grzyby tworzące porosty stanowią główny składnik królestwa grzybów i istotne jest, aby były zaliczane do grupy organizmów wybranych do reprezentowania globalnej bioróżnorodności. Obecnie istnieje intensywne zainteresowanie pozycją filogenetyczną grzybów porostowych i istnieją dowody na to, że wiele nie-lichenized ascomycetes, w tym ekonomicznie ważne rodzaje, takie jak Aspergillus i Penicillium, pochodzą od porostowych przodków. Wiedza o strukturze i sekwencji genomu znacznie promowałaby zrozumienie ewolucji ascomycete, w tym ewolucji genów odpowiedzialnych za syntezę produktów wtórnych i seksualność. Ujawni również specjalizację genomu związaną z porostowym zwyczajem. Cechy te są zgodne z misją DOE do odkrywania i scharakteryzowania podstawowych zasad i relacji leżących u podstaw organizacji, funkcji i ewolucji żywych systemów.
Xanthoria parietina została wybrana jako organizm modelowy do reprezentowania grzybów porostów, ponieważ ma szeroką dystrybucję, ma typową morfologię plechy, jest podatna na uprawy akseniczne i jest jednym z najczęściej badanych grzybów porostów. Dane będą interesujące dla ogólnoświatowych społeczności zajmujących się grzybami, zmianami klimatu i biologią komórek. Oczekuje się, że analiza genomu zapewni wgląd w genetyczne podstawy zjawisk biologicznych, takich jak mutualistyczna symbioza, adaptacja do trudnych warunków, wtórny metabolizm i kontrola tempa wzrostu.
uczestnicy projektu CSP: Paul S. Dyer (proposer), Peter D. Crittenden i David B. Archer (Univ. Nottingham).
Leave a Reply