den lavbildande svampen Xanthoria parietina skulle vara den första lavsvampen som sekvenserades. En lav är en förening mellan en svamp (vanligtvis en ascomycete) och antingen en mikroalga eller en cyanobakterium, eller båda. Lichens betraktas allmänt som det klassiska exemplet på en mutualistisk symbios. Lavar växer i jordlösa livsmiljöer som på stenar eller trädbark eller på dåligt utvecklade jordar. Även om dessa livsmiljöer förekommer i alla markbundna biomer, är de särskilt rikliga vid höga breddgrader i subarktiska, arktiska och antarktiska, där lavar är av stor ekologisk betydelse och där global uppvärmning och klimatförändringar utgör ett särskilt hot.
det finns cirka 13 500 arter av lavbildande svampar, var och en producerar en distinkt lavförening (dvs. en “lavart”). Lavbildande svampar utgör en viktig del av svampriket, och det är viktigt att de ingår i en grupp organismer som valts ut för att representera global biologisk mångfald. Det finns nu ett intensivt intresse för den fylogenetiska positionen hos lavsvampar, och det finns bevis för att många icke-licheniserade ascomycetes, inklusive ekonomiskt viktiga släkten som Aspergillus och Penicillium, härrör från licheniserade förfäder. Kunskap om genomstrukturen och sekvensen skulle i hög grad främja förståelsen för ascomycete evolution, inklusive utvecklingen av gener som är ansvariga för sekundär produktsyntes och sexualitet. Det kommer också att avslöja genomspecialisering relaterad till den licheniserade vanan. Dessa funktioner överensstämmer med DOE-uppdraget att upptäcka och karakterisera grundläggande principer och relationer som ligger till grund för organisationen, funktionen och utvecklingen av levande system.
Xanthoria parietina har valts som en modellorganism för att representera lavbildande svampar eftersom den har en bred fördelning, har en typisk thallusmorfologi, är mottaglig för axenodling och är en av de vanligaste studerade lavsvamparna. Uppgifterna kommer att vara av intresse för de mer allmänna globala svamp -, klimatförändrings-och cellbiologiska samhällena. Genomanalys förväntas ge insikter i den genetiska grunden för biologiska fenomen som mutualistisk symbios, anpassning till hårda miljöer, sekundär metabolism och kontroll av tillväxthastigheten.
CSP-projektdeltagare: Paul S. Dyer (proposer), Peter D. Crittenden och David B. Archer (Univ. från Nottingham).
Leave a Reply